Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NTRK2Q16620 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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