Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP7Q16576 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms