Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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