Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSRP2Q16527 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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