Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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