Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA6Q15825 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA6Q15825 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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