Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIP10Q15642 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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