Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TCEA2Q15560 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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