Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF4Q15306 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms