Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMC1AQ14683 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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