Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAPSNQ13702 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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