Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CUL4AQ13619 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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CUL4AQ13619 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CUL4AQ13619 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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