Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms