Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PPP1R1AQ13522 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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