Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms