Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
XRCC4Q13426 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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