Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNTB2Q13425 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNTB2Q13425 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms