Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SKP2Q13309 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SKP2Q13309 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SKP2Q13309 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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