Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPA4Q13156 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RPA4Q13156 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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RPA4Q13156 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RPA4Q13156 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RPA4Q13156 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RPA4Q13156 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RPA4Q13156 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RPA4Q13156 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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