Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNG1Q06432 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms