Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN11Q06124 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms