Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GRIN1Q05586 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms