Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms