Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLOD1Q02809 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms