Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFRSF17Q02223 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms