Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MAT1AQ00266 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms