Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL7P80098 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL7P80098 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms