Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms