Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BACE1P56817 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BACE1P56817 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BACE1P56817 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BACE1P56817 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BACE1P56817 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BACE1P56817 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BACE1P56817 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms