Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGGT1BP53609 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PGGT1BP53609 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PGGT1BP53609 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PGGT1BP53609 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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