Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACLYP53396 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACLYP53396 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACLYP53396 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms