Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMSP52788 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMSP52788 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms