Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA2P51531 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA2P51531 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms