Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ASCL1P50553 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ASCL1P50553 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ASCL1P50553 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ASCL1P50553 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL1P50553 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL1P50553 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL1P50553 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL1P50553 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL1P50553 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL1P50553 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ASCL1P50553 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms