Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNTAP49354 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNTAP49354 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNTAP49354 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms