Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA8P48165 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJA8P48165 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJA8P48165 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms