Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XCR1P46094 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XCR1P46094 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms