Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDH1P40925 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MDH1P40925 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MDH1P40925 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDH1P40925 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDH1P40925 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MDH1P40925 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms