Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCKBRP32239 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCKBRP32239 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms