Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPS1P31327 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPS1P31327 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPS1P31327 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms