Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TSPOP30536 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TSPOP30536 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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