Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HLA-FP30511 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HLA-FP30511 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms