Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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