Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHA2P29317 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms