Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMA5P28066 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA5P28066 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA5P28066 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA5P28066 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA5P28066 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA5P28066 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMA5P28066 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms