Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PLNP26678 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PLNP26678 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms