Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
POLR2AP24928 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms