Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP11P24347 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms