Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NR4A1P22736 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NR4A1P22736 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms