Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCMT1P22061 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms